Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNC3Q14003 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNC3Q14003 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNC3Q14003 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms