Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KRR1Q13601 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KRR1Q13601 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRR1Q13601 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms