Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
XRCC4Q13426 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XRCC4Q13426 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XRCC4Q13426 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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