Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4Q0VGL1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMTOR4Q0VGL1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4Q0VGL1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms