Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMOD3Q0VAK6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMOD3Q0VAK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMOD3Q0VAK6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMOD3Q0VAK6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms