Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP4Q09028 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP4Q09028 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP4Q09028 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBBP4Q09028 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP4Q09028 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP4Q09028 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RBBP4Q09028 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBBP4Q09028 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms