Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD300CQ08708 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD300CQ08708 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CD300CQ08708 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CD300CQ08708 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CD300CQ08708 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms