Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4CQ08493 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE4CQ08493 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE4CQ08493 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms