Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTK2Q05397 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTK2Q05397 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTK2Q05397 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms