Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPN12Q05209 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPN12Q05209 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPN12Q05209 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms