Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACVR1Q04771 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1Q04771 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms