Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT17Q04695 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT17Q04695 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT17Q04695 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms