Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RELAQ04206 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RELAQ04206 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELAQ04206 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELAQ04206 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELAQ04206 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RELAQ04206 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELAQ04206 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELAQ04206 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms