Protein–RNA interactions for Protein: Q03957

CTK1, CTD kinase subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTK1Q03957 CPR8YNR028W 927 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 TLG2YOL018C 1194 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RPL3YOR063W 1164 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 CAR1YPL111W 1002 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 RBD2YPL246C 789 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 TEL2YGR099W 2067 nt5.34□□□□□ -1.55
CTK1Q03957 IXR1YKL032C 1794 nt5.34□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SMF2YHR050W 1650 nt5.34□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TNA1YGR260W 1605 nt5.34□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 FAA4YMR246W 2085 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TKL1YPR074C 2043 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 HSE1YHL002W 1359 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YDL034WYDL034W 345 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YDL057WYDL057W 987 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 KEG1YFR042W 603 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YGR176WYGR176W 348 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 COS9YKL219W 1224 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ECM1YAL059W 639 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ASN1YPR145W 1719 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SSK22YCR073C 3996 nt5.33□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 VMS1YDR049W 1899 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 AIM10YER087W 1731 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SHE10YGL228W 1734 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 RNY1YPL123C 1305 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ARP2YDL029W 1176 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 COX26YDR119W-A 201 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 GIR2YDR152W 798 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YIL152WYIL152W 708 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 POL32YJR043C 1053 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 RAD10YML095C 633 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YBL077WYBL077W 432 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DAL82YNL314W 768 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 HSP104YLL026W 2727 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TRP3YKL211C 1455 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 STE13YOR219C 2796 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 QDR3YBR043C 2070 nt5.32□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PHO12YHR215W 1404 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PHO11YAR071W 1404 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 NUP1YOR098C 3231 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TBF1YPL128C 1689 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 MID1YNL291C 1647 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DOS2YDR068W 933 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 HIM1YDR317W 1245 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PHO92YDR374C 921 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 CAD1YDR423C 1230 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DDI2YFL061W 678 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 CIA2YHR122W 696 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YKR047WYKR047W 306 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SIC1YLR079W 855 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PGA3YML125C 939 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DDI3YNL335W 678 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 CWC27YPL064C 906 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 APA1YCL050C 966 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DDC1YPL194W 1839 nt5.31□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 MKK2YPL140C 1521 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ATP6Q0085 780 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SOH1YGL127C 384 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ERG20YJL167W 1059 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 MRPL13YKR006C 795 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 RHO4YKR055W 876 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YOR097CYOR097C 528 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PIN2YOR104W 849 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 GAS2YLR343W 1668 nt5.3□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 GPT2YKR067W 2232 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 RTT106YNL206C 1368 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 HSF1YGL073W 2502 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 FAT3YKL187C 2253 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YEA4YEL004W 1029 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YFL012WYFL012W 447 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SNZ3YFL059W 897 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SIP2YGL208W 1248 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YGR219WYGR219W 342 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YLR118CYLR118C 684 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 PRM9YAR031W 897 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YLR317WYLR317W 435 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 COS3YML132W 1140 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SNZ2YNL333W 897 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 MPD1YOR288C 957 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 COS2YBR302C 1140 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TRK2YKR050W 2670 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SMP1YBR182C 1359 nt5.29□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SCT1YBL011W 2280 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 VPS70YJR126C 2436 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 KNH1YDL049C 807 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 ACT1YFL039C 1128 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 TFS1YLR178C 660 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 RPS10BYMR230W 318 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YBL062WYBL062W 381 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 REX4YOL080C 870 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 BBP1YPL255W 1158 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 GRX1YCL035C 333 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 SFB3YHR098C 2790 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 DRN1YGR093W 1524 nt5.28□□□□□ -1.56
CTK1Q03957 EPS1YIL005W 2106 nt5.27□□□□□ -1.57
CTK1Q03957 TEA1YOR337W 2280 nt5.27□□□□□ -1.57
CTK1Q03957 YDR290WYDR290W 330 nt5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms