Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TOP2BQ02880 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
TOP2BQ02880 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms