Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GCNT1Q02742 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GCNT1Q02742 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms