Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLH1Q02575 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NHLH1Q02575 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms