Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CENPEQ02224 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CENPEQ02224 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms