Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFRSF17Q02223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFRSF17Q02223 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms