Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC7A5Q01650 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A5Q01650 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms