Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFITM3Q01628 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFITM3Q01628 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms