Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms