Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RELBQ01201 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RELBQ01201 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RELBQ01201 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RELBQ01201 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RELBQ01201 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RELBQ01201 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RELBQ01201 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RELBQ01201 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RELBQ01201 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms