Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FANCCQ00597 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FANCCQ00597 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms