Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKOR1P84550 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKOR1P84550 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms