Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX1P78414 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX1P78414 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX1P78414 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX1P78414 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX1P78414 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX1P78414 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX1P78414 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX1P78414 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX1P78414 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms