Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNA1P78396 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCNA1P78396 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNA1P78396 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms