Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113P63132 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms