Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RHOBP62745 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RHOBP62745 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RHOBP62745 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOBP62745 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms