Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LSM3P62310 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LSM3P62310 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM3P62310 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM3P62310 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM3P62310 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM3P62310 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM3P62310 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM3P62310 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM3P62310 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM3P62310 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM3P62310 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM3P62310 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM3P62310 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSM3P62310 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms