Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM258P61165 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TMEM258P61165 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM258P61165 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TMEM258P61165 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM258P61165 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMEM258P61165 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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