Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVPABLB-1P60509 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVPABLB-1P60509 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVPABLB-1P60509 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms