Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DEFA1P59665 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DEFA1P59665 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms