Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VSX2P58304 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VSX2P58304 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VSX2P58304 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VSX2P58304 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VSX2P58304 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VSX2P58304 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VSX2P58304 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VSX2P58304 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VSX2P58304 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VSX2P58304 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VSX2P58304 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VSX2P58304 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms