Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSCP56915 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSCP56915 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSCP56915 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GSCP56915 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
GSCP56915 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSCP56915 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSCP56915 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSCP56915 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSCP56915 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSCP56915 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSCP56915 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSCP56915 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms