Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RP1P56715 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RP1P56715 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RP1P56715 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RP1P56715 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RP1P56715 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RP1P56715 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RP1P56715 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RP1P56715 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms