Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL4CP56559 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL4CP56559 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARL4CP56559 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms