Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFRA1P56159 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFRA1P56159 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms