Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH13P55290 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH13P55290 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH13P55290 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH13P55290 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH13P55290 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH13P55290 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH13P55290 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH13P55290 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH13P55290 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH13P55290 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms