Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GEMP55040 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GEMP55040 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GEMP55040 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GEMP55040 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GEMP55040 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GEMP55040 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GEMP55040 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GEMP55040 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GEMP55040 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GEMP55040 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GEMP55040 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GEMP55040 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms