Protein–RNA interactions for Protein: P54803

GALC, Galactocerebrosidase, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALCP54803 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALCP54803 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALCP54803 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALCP54803 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALCP54803 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GALCP54803 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALCP54803 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALCP54803 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALCP54803 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALCP54803 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALCP54803 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALCP54803 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALCP54803 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALCP54803 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALCP54803 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALCP54803 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms