Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNA2D1P54289 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNA2D1P54289 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms