Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRISP3P54108 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRISP3P54108 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRISP3P54108 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms