Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK7P50613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK7P50613 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK7P50613 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK7P50613 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK7P50613 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK7P50613 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK7P50613 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK7P50613 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK7P50613 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK7P50613 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK7P50613 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK7P50613 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK7P50613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK7P50613 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK7P50613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms