Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX2P50458 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX2P50458 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LHX2P50458 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LHX2P50458 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX2P50458 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX2P50458 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX2P50458 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX2P50458 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LHX2P50458 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX2P50458 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX2P50458 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX2P50458 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX2P50458 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms