Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTPAP49638 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTPAP49638 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTPAP49638 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTPAP49638 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTPAP49638 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTPAP49638 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTPAP49638 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTPAP49638 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTPAP49638 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTPAP49638 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTPAP49638 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTPAP49638 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTPAP49638 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTPAP49638 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTPAP49638 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTPAP49638 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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