Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HARS2P49590 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HARS2P49590 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HARS2P49590 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HARS2P49590 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HARS2P49590 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HARS2P49590 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HARS2P49590 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HARS2P49590 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HARS2P49590 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HARS2P49590 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HARS2P49590 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HARS2P49590 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HARS2P49590 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HARS2P49590 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HARS2P49590 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HARS2P49590 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HARS2P49590 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HARS2P49590 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms