Protein–RNA interactions for Protein: P49006

MARCKSL1, MARCKS-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSL1P49006 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MARCKSL1P49006 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MARCKSL1P49006 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms