Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC1P48995 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC1P48995 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms