Protein–RNA interactions for Protein: P48664

SLC1A6, Excitatory amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A6P48664 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A6P48664 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A6P48664 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A6P48664 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms